МОЛЕКУЛЯРНА ІДЕНТИФІКАЦІЯ ТА АНТИБАКТЕРІАЛЬНА АКТИВНІСТЬ МАКРОГРИБА Trametes sanguine (L.) Houda Sbayou, Hazal Gür, Fatih Özen, Fatma Buşra Işik, Souad Amghar, Abdellatif Elharti, Muhsin Konuk, Belkis Atasever Arslan

Деталі: Перегляди: 260

ISSN 2410-7751 (Print)
ISSN 2410-776X (Online)

cover biotech acta general

Biotechnologia Acta Т. 15, No. 6 , 2022
P. , Bibliography 26, Engl.
UDC:5.283.+615.277.3
DOI: https://doi.org/10.15407/biotech15.06.070

Повний текс: (PDF, англ.)

МОЛЕКУЛЯРНА ІДЕНТИФІКАЦІЯ ТА АНТИБАКТЕРІАЛЬНА АКТИВНІСТЬ МАКРОГРИБА Trametes sanguine (L.)

Houda Sbayou ¹, Hazal Gür ², Fatih Özen ², Fatma Buşra Işik ³, Souad Amghar ³, Abdellatif Elharti ³, Muhsin Konuk ¹, Belkis Atasever Arslan ¹

¹Department of Molecular Biology and Genetics, Faculty of Engineering and Natural Sciences, Üsküdar University, Istanbul, Turkey.
²Department of Bioengineering, Faculty of Engineering and Natural Sciences, Üsküdar University, Istanbul, Turkey.
³Laboratory for improved soil productivity and environment, Higher Normal School

Мета. Молекулярну ідентифікацію Pycnoporus sanguies, раніше морфологічного гриба, було проведено для виявлення антибактеріальної активності щодо патогенних бактерій Staphylococcus aureus і Salmonella typhi.

Методи. Фрагмент ділянки D2 28S рДНК ампліфікували за допомогою ПЛР, секвенували та проводили BLAST з використанням консенсусної послідовності. Для побудови філогенетичного дерева використовували максимальний бал ідентичності. Для вивчення антибактеріальної активності використовували дифузію в агарі.

Результати. Було проведено секвенування ПЛР-амплікону на 700 пар основ і згенеровано 616 пар основ ділянки D2 гена великої субодиниці. 100 бласт-попадань на ділянку D2 гена LSU показали подібність до Trametes sanguinea voucher PRSC95 (номер доступу GenBank: JN164795.1) на основі гомології нуклеотидів і філогенетичного аналізу. Антибактеріальний скринінг показав, що Staphylococcus aureus має вищу активність із зоною інгібування від 3 мм до 13 мм і мінімальною інгібувальною концентрацією 100 г порівняно з Salmonella typhi, що має зону інгібування від 5 мм до 15 мм і мінімальну інгібувальну концентрацію 200 г.

Висновок. Відповідно до отриманого результату морфологічно ідентифікований гриб Pycnoporus sanguies можна віднести до Trametes sanguine, і він може бути антибактеріальним засобом.

Ключові слова: макрогриби. Tramates, ПЛР, філогенетичний аналіз, антимікробна активність.