Оберіть свою мову

 

SSN 2410-7751 (Print)
ISSN 2410-776X (Online)

cover biotech acta general

Biotechnologia Acta Т. 18, N. 6, 2025
С. 68-70, Bibliography 9, Engl.
UDC: 57.08:577.1:577.152.3:579.66:544.723:628.5/.6
doi: https://doi.org/10.15407/biotech18.06.068

Повний текст (PDF, англ.)

ВИКОРИСТАННЯ БІОІНФОРМАТИЧНИХ МЕТОДІВ ДЛЯ АНАЛІЗУ ПРОТЕЇНОВИХ МІШЕНЕЙ МІКРООРГАНІЗМІВ ПРОДУЦЕНТІВ БІОСУРФАКТАНТІВ

Є.Б. Январьов 1, В.В. Гавриляк 1, Г.В. Мельник 2, В.О. Степаненко 2

 1 Кафедра технології біологічно активних сполук, фармації та біотехнології, Національний університет «Львівська політехніка», Україна
2 Національний технічний університет України «Київський політехнічний інститут імені Ігоря Сікорського»

Мета. Метою було визначити ключові протеїнові мішені, що беруть участь у метаболізмі, регуляції та транспорті біосурфактантів. і слугуватимуть основою для подальших досліджень з використанням зворотного молекулярного докінгу.

Методи. Протеїнові мішені було ідентифіковано за допомогою біологічних баз даних з відкритим
доступом, включаючи RCSB PDB та UniProt, з акцентом на мікроорганізми, визнані продуцентами
біосурфактантів. Було проаналізовано відповідні джерела літератури для підтвердження функціо-
нальної ролі певних протеїнів у метаболізмі біосурфактантів. Критерії відбору охоплювали протеїни,
безпосередньо залучені до ензиматичного синтезу, механізмів транспорту та регуляції експресії генів,
пов’язаних із виробництвом біосурфактантів.

Результати. Було ідентифіковано вісім протеїнових мішеней, пов'язаних із интезом біосурфактантів. Функціональна анотація та валідація літератури підтвердили їхню актуальність для метаболізму мікробних біосурфактантів.

Висновки. Ці результати забезпечують міцну основу для подальших досліджень, включаючи комп'ютерне моделювання та експериментальну валідацію, щоби з’ясувати роль ідентифікованих протеїнів біосурфактантів. Дослідження підкреслює важливість інтеграції електронних баз даних з аналізом літератури для визначення потенційних біомолекулярних мішеней для майбутніх біотехнологічних застосувань.

Ключові слова: біосурфактанти, бази даних, протеїнові мішені, молекулярний докінг, мікробіологічний метаболізм.

© Інститут біохімії ім. О. В. Палладіна НАН України, 2025