Biotechnologia Acta

...

  • Увеличить размер шрифта
  • Размер шрифта по умолчанию
  • Уменьшить размер шрифта
Home New publications for RSS
2017
Печать PDF

КЛАСТЕРНЫЙ АНАЛИЗ В БИОТЕХНОЛОГИИ

Е. М. Ключко

Ж-л "Biotechnologia Acta" Т. 10, № 5, 2017
https://doi.org/10.15407/biotech10.05.005

Абстракт
Целью работы был анализ методов кластерного анализа и возможность их применения в биотехнологии. Поскольку существует определенный опыт применения этих методов в биологии и медицине, проанализированы соответствующие публикации. Приведена краткая характеристика основных принципов кластерного анализа, использование их в биологии и медицине и отдельные примеры — в биотехнологии. Рассмотрены результаты исследований биотехнологических проблем с помощью кластерных методов в комплексе с другими математическими подходами. В выводах приведены результаты выполненного анализа, а также рекомендации по применению методов кластерного анализа в биотехнологии.

Полный текст: PDF


 

ПОВЫШЕНИЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ ЭКСПРЕССИИ РЕКОМБИНАНТНЫХ scFv-АНТИТЕЛ О.В. Галкин, Т.А. Чудина, А.А. Сиромолот, Е.С. Олейник

Печать PDF

ПОВЫШЕНИЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ ЭКСПРЕССИИ РЕКОМБИНАНТНЫХ scFv-АНТИТЕЛО.В. Галкин, Т.А. Чудина, А.А. Сиромолот, Е.С. Олейник

Ж-л "Biotechnologia Acta" Т. 10, № 5, 2017
https://doi.org/10.15407/biotech10.05.019

Абстракт

Получение рекомбинантных одноцепочечных вариабельных фрагментов антител scFv (single-chain fragment variable) в клетках E. coli часто связано с рядом проблем, которые обусловливают низкий уровень выхода и неактивную форму продукта.

Целью этой работы было исследовать влияние фрагмента стафилококкового протеина А (SpA) в составе слитого протеина с scFv-антителами на эффективность экспрессии конечного продукта. На примере scFv-антител различного происхождения и специфичности показано, что уровень их экспрессии в слитой с D-E-A-A * фрагментом SpA форме значительно превышал уровень экспрессии свободных scFv в аналогичной экспрессион системе. При этом, в составе слитых белков scFv-антитела сохраняли свои антиген-связывающие свойства, а фрагмент белка А - способность связывать другие иммуноглобулины.

Таким образом, предложенная стратегия может использоваться как эффективный подход для повышения эффективности продукции scFv-антител в клетках E.coli.

Полный текст: PDF


 

ТЕХНОЛОГИЯ ВОСПРОИЗВОДСТВА СТЕРЛЯДИ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ КРИОКОНСЕРВИРОВАННОЙ СПЕРМЫ Л. П. Драган, А. И. Мрук, В. М. Голиан, Л.П. Бучацкий

Печать PDF

ТЕХНОЛОГИЯ ВОСПРОИЗВОДСТВА СТЕРЛЯДИ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ КРИОКОНСЕРВИРОВАННОЙ СПЕРМЫ
Л. П. Драган, А. И. Мрук, В. М.  Голиан, Л.П. Бучацкий

Ж-л "Biotechnologia Acta" Т. 10, № 5, 2017
https://doi.org/10.15407/biotech10.05.030

Целью работы было воспроизводство стерляди дунайской и днепровской популяций с помощью криоконсервованной спермы, замороженной в модифицированной криозащитной среде.

Низкотемпературное консервирование репродуктивных клеток самцов стерляди проводили согласно общепринятым в криобиологии методикам.

В результате проведенных работ установлено, что использованная среда, в состав которой входит способствующий криозащитному эффекту метанол, является технологически оптимальной для процесса хранения спермы и воспроизводства дунайской и днепровской популяций стерляди. Во время оттаивания замороженных сперматозоидов рыб, которые сохранили жизнеспособность после криоконсервации, их способность к оплодотворению яйцеклеток восстанавливалась, несмотря на то, что подвижность таких спермиев в некоторой степени замедлялась. Полученные подобным способом личинки от двух популяций стерляди использовались для воспроизводства ремонтно - маточных стад в условиях рыбоводческого хозяйства.

Проведенные исследования оптимизации стандартной методики криоконсервации спермы стерляди могут быть рекомендованы для применения на коммерческих предприятиях с целью товарного выращивания осетровых рыб.

Полный текст: PDF


 

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ АЛЬТЕРНАТИВНЫХ СУБСТРАТОВ ДЛЯ НАКОПЛЕНИЯ БИОБУТАНОЛА ПРИ КУЛЬТИВИРОВАНИИ ШТАММОВ Clostridium acetobutylicum Е. А. Тигунова, А. С. Андрияш, Н. Е. Бейко, И. В. Мельник, С. М. Шульга

Печать PDF

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ АЛЬТЕРНАТИВНЫХ СУБСТРАТОВ ДЛЯ НАКОПЛЕНИЯ БИОБУТАНОЛА ПРИ КУЛЬТИВИРОВАНИИ ШТАММОВ Clostridium acetobutylicum
Е. А. Тигунова, А. С. Андрияш, Н. Е. Бейко, И. В. Мельник, С. М. Шульга

Ж-л "Biotechnologia Acta" Т. 10, № 5, 2017
https://doi.org/10.15407/biotech10.05.036

Абстракт
Целью работы было исследовать накопление биобутанола штаммами Clostridium acetobutylicum с использованием альтернативных субстратов (сока топинамбура, технического гліцерола, гліцерола-сырца, измельченной зелёной биомасы сои, рапса, прутевидного проса, пшеницы). Для повышения накопления бутанола в процессе культивирования проводили иммобилизацию клеток С. acetobutylicum на носителях (полосках бельтинга, ферритовых кольцах, кольцах Рашига) статическим способом — методом адсорбционной иммобилизации. Клетки осаждали с помощью центрифугирования, супернатант перегоняли и определяли продукты брожения. Наличие растворителей в культуральной жидкости определяли с помощью газовой хроматографии. Максимальное накопление бутанола (2 г/дм3) наблюдали при концентрации в среде глицерола-сырца 16 г/дм3, а полное ингибирование развития культуры — при 25 г/дм3. Накопление бутанола штаммом C. Acetobutylicum ІМВ В-7407 при культивировании отъемно-доливным методом зависит от количества отъема и долива среды. Иммобилизация культуры с использованием колец Рашига дала возможность повысить биоконверсию до бутанола в 2 раза. Таким образом, для получения бутанола была показана возможность использования нетрадиционных субстратов. Наибольшее накопление бутанола было достигнуто при использовании глицерола (11 г/дм3) как водорастворимого субстрата и как лигноцеллюлозного — прутевидного проса (2,6 г/дм3). Иммобилизация клеток культуры С. acetobutylicum на носителях повышала накопление бутанола. Использование колец Рашига в качестве носителя для иммобилизации позволило повысить накопление бутанола в 2 раза.

Полный текст: PDF


 
Печать PDF

УГНЕТЕНИЕ ЭКСПРЕССИИ ФИЗИОЛОГИЧЕСКИХ ПРИОНОВ АНТИСЕНС-ОЛИГОНУКЛЕОТИДАМИ
Н. Ю. Сусол, Д. Д. Остапов, В. В. Влизло

Ж-л "Biotechnologia Acta" Т. 10, № 5, 2017
https://doi.org/10.15407/biotech10.05.043

Абстракт
Целью работы было исследование способности новых комплексов специфических однонитевых олигонуклеотидов ‒ асОДН ‒ с полимерными носителями на основе диметиламинометилакрилата подавлять экспрессию физиологического приона. Установлено, что введение комплексов вновь синтезированных носителей на основе диметиламинометилметакрилат- PEG-DMAEM-MP-27 (магнитные частички) (MP-27), PEG- DMAEM-MP-2 (MP-2), PEG- DMAEM-MP-3 (MP-3) с асОДН в организм крыс приводит к снижению содержания приона в тканях селезенки и тонкого кишечника. Также было изучено влияние комплексов вновь синтезированных носителей: MP-27, MP-2 и MP-3 с асОДН на гематологические и биохимические показатели крови крыс Вистар.

Полный текст: PDF


УГНЕТЕНИЕ ЭКСПРЕССИИ ФИЗИОЛОГИЧЕСКИХ ПРИОНОВ

АНТИСЕНС-ОЛИГОНУКЛЕОТИДАМИ

Н. Ю. Сусол, Д. Д. Остапов, В. В. Влизло

 

ОСОБЕННОСТИ ГИДРАТАЦИИ КОМПОЗИТНЫХ СИСТЕМ НА ОСНОВЕ ВЫСОКОДИСПЕРСНОГО КРЕМНЕЗЕМА И САХАРОЗЫ В РАЗНЫХ СРЕДАХ Туров В.В., Крупская Т.В., Головань А.П., Картель Н.Т.,

Печать PDF

Ж-л "Biotechnologia Acta" Т. 10, № 5, 2017
https://doi.org/10.15407/biotech10.05.051

ОСОБЕННОСТИ ГИДРАТАЦИИ КОМПОЗИТНЫХ СИСТЕМ НА ОСНОВЕ ВЫСОКОДИСПЕРСНОГО КРЕМНЕЗЕМА И САХАРОЗЫ В РАЗНЫХ СРЕДАХ

Туров В.В., Крупская Т.В., Головань А.П., Картель Н.Т.,

Абстракт
Методом низкотемпературной 1Н ЯМР спектроскопии изучено состояние воды в гидратированном порошке сахарозы, ее расплаве и композитных системах, содержащих 3 части кремнезема (А-300 или АМ1) и 1 часть сахарозы в воздушной среде, среде слабополярного органического растворителя – дейтерохлороформа и среде CDCl3 с добавками сильных кислот. Показано, что при совместной механоактивации сахарозы с нанокремнеземом происходит ее аморфизация. При этом адсорбция воды в таком композите не сопровождается процессом растворения иммобилизованной на поверхности SiO2 сахарозы в межфазной воде. Обнаружен эффект повышения растворимости сахарозы при помещении композита в среду, не растворяющую воду и сахарозу, органического растворителя – дейтерохлороформа. Высказано предположение, что он обусловлен увеличением площади контакта кластеров адсорбированной воды с поверхностью сахарозы. Максимальная концентрация сахарозы, растворяющейся в межфазной воде, составляет около 30 мас.%. При сохранении соотношения концентраций компонентов и количества адсорбированной воды, замена гидрофильного кремнезема (А-300) на гидрофобный (АМ1) снижает свободную энергию связывания воды в композитной системе. Полученные закономерности могут быть использованы при конструировании нового поколения энтеросорбентов.

Полный текст: PDF

 


 

ВЛИЯНИЕ НАНОЧАСТИЦ ДИОКСИДА ЦЕРИЯ НА ПРОРАСТАНИЕ СЕМЯН И НАКОПЛЕНИЕ ПЛАСТИДНИХ ПИГМЕНТОВ И ФЕНОЛЬНЫХ СОЕДИНЕНИЙ В ПРОРОСТКАХ СОСНЫ OБЫКНОВЕННОЙ (Pinus sylvestris L.) А. П. Пинчук, А. Ф. Лиханов, Л. П. Бабенко, М. В. Кривцова, А. А. Демченко, А. Б. Щ

Печать PDF

ВЛИЯНИЕ НАНОЧАСТИЦ ДИОКСИДА ЦЕРИЯ НА ПРОРАСТАНИЕ СЕМЯН
И НАКОПЛЕНИЕ ПЛАСТИДНИХ ПИГМЕНТОВ
И ФЕНОЛЬНЫХ СОЕДИНЕНИЙ В ПРОРОСТКАХ СОСНЫ OБЫКНОВЕННОЙ (Pinus sylvestris L.)

А. П. Пинчук, А. Ф. Лиханов, Л. П. Бабенко, М. В. Кривцова, А. А. Демченко, А. Б. Щербаков, Л. Н. Лазаренко, Н. Я. Спивак

Ж-л "Biotechnologia Acta" Т. 10, № 5, 2017
https://doi.org/10.15407/biotech10.05.063

Абстракт
Целью работы было исследование влияния наночастиц диоксида церия на прорастание семян с последующими физиологическими изменениями в накоплении пластидних пигментов и фенольных соединений в тканях проростков сосны обыкновенной (Pinus sylvestris). Установлено, что кратковременное замачивание семян сосны в растворах наночастиц диоксида церия (2–4 нм) увеличивало их всхожесть и энергию прорастания в 1,3 раза. В проростках, полученных из шестимесячных семян, через 14 дней после их обработки наблюдалось снижение содержания хлорофилла b, фенолов и фенилаланина. Одновременно увеличивалась концентрация каротиноидов и флавоноидов. Это указывает на общее снижение активности фенилпропаноидного синтеза. На этом основании сделано предположение, что наночастицы диоксида церия, которые входят в клетки семян сосны обыкновенной, в дальнейшем принимают участие в регуляции процессов синтеза фенолов и терпеноидов в проростках, что соответственно влияет на интенсивность их роста и развития.

Полный текст: PDF

 

 

ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДА ИСКУССТВЕННЫХ НЕЙРОННЫХ СЕТЕЙ В БИОТЕХНОЛОГИИ Е. М. Ключко

Печать PDF

Ж-л "Biotechnologia Acta" Т. 10, № 4, 2017
https://doi.org/10.15407/biotech10.04.005

Абстракт
ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДА ИСКУССТВЕННЫХ НЕЙРОННЫХ СЕТЕЙ В БИОТЕХНОЛОГИИ Е. М. Ключко

Целью работы был анализ метода искусственных нейронных сетей с точки зрения перспектив его применения в биотехнологии. Поскольку в современной науке существует большое количество данных о применении этого метода, для достижения поставленной цели было проанализировано около 300 публикаций. В статье дана характеристика искусственных нейронных сетей, описание и анализ метода, примеры использования в биологии и медицине. Рассмотрено применение этого метода для исследования сложных проблем в отраслях, для которых он был использован в комплексе с другими современными математическими методами. В выводах приведены результаты выполненного анализа и рекомендации относительно применения этого метода в биотехнологии.

Полный текст: PDF


 

АДЪЮВАНТНЫЕ СВОЙСТВА НАНОЧАСТИЦ С ИММОБИЛИЗОВАННЫМ ФРАГМЕНТОМ ДИФТЕРИЙНОГО ТОКСОИДА Т. А. Чудина, А. Ю. Лабынцев, Д. В. Колибо, С. В. Комисаренко

Печать PDF

Ж-л "Biotechnologia Acta" Т. 10, № 4, 2017
https://doi.org/10.15407/biotech10.04.014

Абстракт

АДЪЮВАНТНЫЕ СВОЙСТВА НАНОЧАСТИЦ С ИММОБИЛИЗОВАННЫМ ФРАГМЕНТОМ ДИФТЕРИЙНОГО ТОКСОИДА Т. А. Чудина, А. Ю. Лабынцев, Д. В. Колибо, С. В. Комисаренко

Целью работы было сравнение характеристик частиц с разным химическим строением и размерами (коллоидного золота Gold 1 и Gold 2, фосфата кальция CaP и поли(лактид-коглюколида) PLGA 1 и PLGA 2) для поиска наиболее эффективных носителей антигена — рекомбинантного дифтерийного токсоида — при иммунизации per os. По данным МТТ-теста все исследуемые частицы не проявляли заметного цитотоксического воздействия по отношению к рассматриваемым клеткам in vitro, за исключением частиц СAР, которые в высоких концентрациях оказывали цитотоксическое влияние на клетки линии U937, и частиц Gold 1 и Gold 2, также подавивших рост клеток линии L929. Наиболее выраженное фагоцитирование макрофагоподобными клетками линии J774 было зафиксировано для частиц PLGA 1 и PLGA 2 с иммобилизованным антигеном, в то время как конъюгаты частиц Gold 1 и Gold 2 с антигеном оказались способными к сорбции на поверхности этих клеток, но не поглощались ими. У мышей BALB/с, получавших перорально антиген, иммобилизованный на носителях PLGA 1 и PLGA 2, а также Gold 2, концентрация в крови антител IgA, специфичных к субъединице В — SubB, заметно увеличивалась по сравнению с контролем уже после второй иммунизации. У группы мышей, получавших конъюгаты антигена с PLGA 2, отмечено также увеличение концентрации специфических IgG в крови после третьей иммунизации. Приведенные результаты свидетельствуют о перспективности исследования частиц PLGA 1 и PLGA 2 в качестве адъювантов для иммунизации per os.

Полный текст: PDF

 


 

ИНТЕНСИФИКАЦИЯ БИОСИНТЕЗА МИКРОБНОГО ЭКЗОПОЛИСАХАРИДА ЭТАПОЛАНА НА СМЕСИ МЕЛАССЫ И ПОДСОЛНЕЧНОГО МАСЛА Т. П. Пирог А. А. Вороненко Н. А. Ивахнюк

Печать PDF

Ж-л "Biotechnologia Acta" Т. 10, № 4, 2017
https://doi.org/10.15407/biotech10.04.025

Абстракт

ИНТЕНСИФИКАЦИЯ БИОСИНТЕЗА МИКРОБНОГО ЭКЗОПОЛИСАХАРИДА ЭТАПОЛАНА НА СМЕСИ МЕЛАССЫ И ПОДСОЛНЕЧНОГО МАСЛА Т. П. Пирог А. А. Вороненко Н. А. Ивахнюк

Целью работы было установление условий культивирования Acinetobacter sp. ИМВ В-7005, обеспечивающих максимальные показатели синтеза микробного экзополисахарида этаполана на смеси мелассы и подсолнечного масла, а также исследование возможности замены рафинированного масла в смеси с мелассой на отработанное. На основе теоретических расчетов энергозатрат на синтез этаполана и биомассы определено, что оптимальное молярное соотношение концентраций энергетически дефицитного (сахароза) и избыточного (подсолнечное масло) субстратов в смеси составляет 1,0:0,9. Эксперименты показали, что наиболее высокие показатели синтеза микробного экзополисахарида наблюдались при молярном соотношении моносубстратов в смеси 1,0:1,1, максимально приближенном к теоретически рассчитанному. Повышение концентрации мелассы и рафинированного масла в смеси с 1,0 до 1,5% сопровождалось увеличением количества синтезированного микробного экзополисахарида и его синтезирующей способности в 1,2 и 1,3 раза соответственно. Установлена возможность замены рафинированного масла в смеси с мелассой на различные типы отработанного (после жарки картофеля, мяса, овощей и смешанного). Максимальные показатели синтеза микробного экзополисахарида (концентрация 14 г/л, синтезирующая способность 3,5 г микробного экзополисахарида/г биомассы) наблюдались при использовании смешанного отработанного масла как для получения посевного материала, так и биосинтеза микробного экзополисахарида. Полученные результаты свидетельствуют о возможности создания универсаЦелью работы было установление условий культивирования Acinetobacter sp. ИМВ В-7005, обеспечивающих максимальные показатели синтеза микробного экзополисахарида этаполана на смеси мелассы и подсолнечного масла, а также исследование возможности замены рафинированного масла в смеси с мелассой на отработанное. На основе теоретических расчетов энергозатрат на синтез этаполана и биомассы определено, что оптимальное молярное соотношение концентраций энергетически дефицитного (сахароза) и избыточного (подсолнечное масло) субстратов в смеси составляет 1,0:0,9. Эксперименты показали, что наиболее высокие показатели синтеза микробного экзополисахарида наблюдались при молярном соотношении моносубстратов в смеси 1,0:1,1, максимально приближенном к теоретически рассчитанному. Повышение концентрации мелассы и рафинированного масла в смеси с 1,0 до 1,5% сопровождалось увеличением количества синтезированного микробного экзополисахарида и его синтезирующей способности в 1,2 и 1,3 раза соответственно. Установлена возможность замены рафинированного масла в смеси с мелассой на различные типы отработанного (после жарки картофеля, мяса, овощей и смешанного). Максимальные показатели синтеза микробного экзополисахарида (концентрация 14 г/л, синтезирующая способность 3,5 г микробного экзополисахарида/г биомассы) наблюдались при использовании смешанного отработанного масла как для получения посевного материала, так и биосинтеза микробного экзополисахарида. Полученные результаты свидетельствуют о возможности создания универсальной технологии получения микробного экзополисахарида этаполана на льной технологии получения микробного экзополисахарида этаполана на смеси отходов (мелассы и отработанного масла), не зависящей от типа и поставщика отработанного масла.

Полный текст: PDF


 

УГНЕТЕНИЕ ІRE1 ИЗМЕНЯЕТ ЭФФЕКТ ДЕФИЦИТА ГЛУТАМИНА НА ЭКСПРЕССИЮ ГРУППЫ ПРОТЕАЗ В КЛЕТКАХ ГЛИОМЫ ЛИНИИ U87 О. В. Галкин, О. О. Рябовол, Д. О. Минченко, А.Ю. Кузнецова, О. О. Ратушна, О. Г. Минченко

Печать PDF

Ж-л "Biotechnologia Acta" Т. 10, № 4, 2017
https://doi.org/10.15407/biotech10.04.034:

Абстракт

УГНЕТЕНИЕ ІRE1 ИЗМЕНЯЕТ ЭФФЕКТ ДЕФИЦИТА ГЛУТАМИНА НА ЭКСПРЕССИЮ ГРУППЫ ПРОТЕАЗ В КЛЕТКАХ ГЛИОМЫ ЛИНИИ U87

О. В. Галкин, О. О. Рябовол, Д. О. Минченко, А.Ю. Кузнецова, О. О. Ратушна, О. Г. Минченко

Целью работы было изучить влияние дефицита глутамина на экспрессию генов, кодирующих HTRA1/PRSS11, LONP1/PRSS15 и некоторые катепсины в клетках глиомы линии U87 при угнетении IRE1 (inositol requiring enzyme-1). Показано, что в контрольных (трансфецированных пустым вектором) клетках глиомы дефицит глутамина усиливал экспрессию генов LONP1, CTSD, CTSF, CTSO и CTSS, угнетал экспрессию генов HTRA1, CTSC и CTSK, но существенно не влиял на экспрессию генов CTSA, CTSB и CTSL. Угнетение функции сигнального энзима IRE1 в клетках глиомы линии U87 изменяло эффект дефицита глутамина на экспрессию генов HTRA1, LONP1, CTSD, CTSL, CTSO и CTSS: снимало эффект дефицита глутамина на гены HTRA1 и CTSO, индуцировало — на ген CTSL, уменьшало — на ген CTSD и усиливало — на гены LONP1 и CTSL. Таким образом, дефицит глутамина изменял уровень экспрессии большинства изученных генов в зависимости от функциональной активности энзима IRE1, центрального медиатора стресса эндоплазматического ретикулума, отвечающего за контроль пролиферации клеток и роста опухолей.

Полный текст: PDF


 


Страница 1 из 4

Дополнительное меню

Поиск по сайту

Навигация на сайте

Home New publications for RSS

Приглашение к сотрудничеству

Господа! Редакция приглашает Вас публиковать свои работы на страницах нашего журнала. © Институт биохимии им. А. В. Палладина НАН Украины. Все права защищены. Полная или частичная перепечатка материалов журнала только с письменного разрешения редакции. E-mail для справок: biotech@biochem.kiev.ua