Biotechnologia Acta

...

  • Увеличить размер шрифта
  • Размер шрифта по умолчанию
  • Уменьшить размер шрифта
Home Архив 2020 № 2 ДЕТЕКЦИЯ СУЛЬФАТРЕДУЦИРУЮЩИХ БАКТЕРИЙ ИЗ РАЗЛИЧНЫХ ЭКОТОПОВ МЕТОДОМ ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ Д. Р. Абдулина, Г. А Иутинская, А. И. Анискина, М. М. Никитин
Печать PDF

ISSN 2410-7751 (Печатный вариант)
ISSN 2410-776X (электронная версия)

Ж-л Biotechnologia Acta Т. 13, № 2, 2020
С. 38-47, библ. 22, англ.
УДК: 579.63:577.29
https://doi.org/10.15407/biotech13.02.038

ДЕТЕКЦИЯ СУЛЬФАТРЕДУЦИРУЮЩИХ БАКТЕРИЙ ИЗ РАЗЛИЧНЫХ ЭКОТОПОВ МЕТОДОМ ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ

Д. Р. Абдулина1, Г. А Иутинская1, А. И. Анискина2, М. М. Никитин2

1Институт микробиологии и вирусологии им. Д. К. Заболотного НАН Украины, Киев Украина
2ООО ГенБит, Москва, РФ

Проведено исследование эффективности выявления сульфатредуцирующих бактерий в образцах из разных экотопов микробиологическим (культуральным методом предельных разведений) и молекулярно-биологическим методом (ПЦР в режиме реального времени) с помощью разработанных тестсистем на лиофилизированных кремниевых микрочипах. Были использованы тест-систем DSRM и SRB2 для выявления наличия функционального гена dsrA, кодирующего один из ключевых ферментов диссимиляционной сульфатредукции — диссимиляционную сульфитредуктазу. Установлено, что минимально определяемые титры сульфатредуцирующих бактерий в водных образцах составляют 104 кл/мл, в грунтовых — от 102 до 105 кл/г абсолютно сухого грунта. В природных и техногенных образцах количество сульфатредуцирующих бактерий, выявленное микробиологическим методом, коррелировало с рассчитанными значениями титров, определенными с помощью молекулярно-биологического метода, индексы Пирсона составили r = 0.41–0.69 (k = 11, P ≤ 0.01–0.05). ПЦР в режиме реального времени с разработанными тест-системами на кремниевом микрочипе является надёжным качественным экспресс-методом для детекции сульфатредуцирующих бактерий в различных природных и техногенных экотопах.

Kлючевые слова: dsrA ген, тест-системы, сульфатредуцирующие бактерии, биокоррозия, ПЦР в режиме реального времени.

© Институт биохимии им. А. В. Палладина НАН Украины, 2020


 

Дополнительное меню

Поиск по сайту

Навигация на сайте

Home Архив 2020 № 2 ДЕТЕКЦИЯ СУЛЬФАТРЕДУЦИРУЮЩИХ БАКТЕРИЙ ИЗ РАЗЛИЧНЫХ ЭКОТОПОВ МЕТОДОМ ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ Д. Р. Абдулина, Г. А Иутинская, А. И. Анискина, М. М. Никитин

Приглашение к сотрудничеству

Господа! Редакция приглашает Вас публиковать свои работы на страницах нашего журнала. © Институт биохимии им. А. В. Палладина НАН Украины. Все права защищены. Полная или частичная перепечатка материалов журнала только с письменного разрешения редакции. E-mail для справок: biotech@biochem.kiev.ua